El Servicio Nacional del Patrimonio Cultural está compuesto por varias subdirecciones que se enfocan y especializan en temas relativos al patrimonio cultural. Es así como se gestaron las siguientes:
Subdirección Nacional de Museos que tiene como misión promover el desarrollo armónico y sostenido de los museos de Chile.
Subdirección de Fomento y Gestión Patrimonial que tiene por misión apoyar y promover la gestión sostenible y la preservación del patrimonio cultural de Chile, en especial el patrimonio mueble en todas sus formas, el inmaterial o relacionado con la memoria y el declarado Patrimonio Mundial por Unesco.
Subdirección de Investigación que tiene como misión impulsar, definir, promover y difundir la investigación en coherencia con las políticas y estrategias de indagación definidas en el Servicio Nacional del Patrimonio Cultural, con el fin de potenciar la generación de nuevo conocimiento y poner en valor tanto sus colecciones como el patrimonio natural y cultural del país.
Subdirección Nacional de Pueblos Originarios y Tribal Afrodescendiente chileno que tiene como misión reconocer, respetar y promover las culturas de los pueblos indígenas y Tribal Afrodescendiente chileno, sus prácticas ancestrales, sus creencias, su historia y su cosmovisión, teniendo especial consideración con el desarrollo de la cultura, las artes y el patrimonio cultural indígena y tribal afrodescendiente.
Subdirección Nacional de Patrimonio Cultural Inmaterial que tiene como misión apoyar la gestión sostenible de patrimonio cultural inmaterial presente en el país a través del Proceso para la Salvaguardia del Patrimonio Cultural Inmaterial en Chile, resguardando el cumplimiento de la Convención Unesco 2003 y sus principios éticos en Chile y promoviendo la diversidad cultural y el desarrollo territorial.
